Pembimbingan Tugas Akhir Mahasiswa S1 Kelris Genetika Tumbuhan
Pembimbingan Tugas Akhir Mahasiswa S1 Kelris Genetika Tumbuhan
Pembimbingan Tugas Akhir Mahasiswa S1 Kelris Genetika Tumbuhan
Gratis


DESKRIPSI LAYANAN | Kelris: Genetika Tumbuhan  Deskripsi Kelris  Melakukan kegiatan riset dan inovasi dengan ruang lingkup riset meliputi Sekuensing/pengurutan genom tumbuhan dengan platform Next-Generation Sequencing (NGS) short-reads dan/atau long-reads; Analisis…

  • Pusat Riset Botani Terapan
  • KST Cibinong (Soekarno)
  • Satuan Layanan: orang
  • Waktu Pengerjaan Layanan: 6 Bulan
  • Kuota Pelayanan Per Hari: 4
  • Kapasitas Layanan: 1 orang
  • Jumlah Minimal Pengajuan: 1
Ajukan Layanan
Kelris: Genetika Tumbuhan 

Deskripsi Kelris 
Melakukan kegiatan riset dan inovasi dengan ruang lingkup riset meliputi Sekuensing/pengurutan genom tumbuhan dengan platform Next-Generation Sequencing (NGS) short-reads dan/atau long-reads; Analisis bioinformatika raw data: quality control, assembly, annotation (tahapan yang memerlukan sumberdaya komputasi tinggi: HPC-BRIN dan/atau Platform Galaxy); Pemanfaatan sekuens DNA ber-anotasi skala genom: Genomika Komparatif, Genomika Fungsional, Genomika Struktural, dan analisis keragaman genetika tumbuhan. 

Topik penelitian yang ditawarkan : 
1. Riset tentang sekuensing DNA tumbuhan level genom dengan teknologi NGS. Kegiatan berfokus pada aspek Bioinformatika (analisis in-silico): Assembly, Anotasi Struktural, Anotasi Fungsional, Keragaman Genetik pada tingkat genom. Output berupa genome kloroplas utuh dengan anotasi, ribosomal RNA utuh/nuclear ribosomal cistron (18S-ITS1-5.8S-ITS2-26S), draft genom mitokondria, dan draft genome inti/nuclear. Terhadap gen-gen yang teridentifikasi, dapat digunakan sebagai fondasi untuk studi lebih lanjut: karakterisasi, komparasi, studi gen fungsional.
2. Reidentifikasi Tumbuhan Terancam Kepunahan Koleksi Kebun Raya Bogor dengan metode Morfologi dan Molekuler: Studi Kasus Dillenia spp. asal Sulawesi
3. Studi Sebaran Benih Shorea spp dengan Pendekatan Molekuler

Kuota: 2 mahasiswa 
Lokasi Penelitian: Bogor dan Cibinong 

Syarat Pengajuan:
  • Surat Pengantar
  • File Data Transkrip
  • File Data Foto
  • File Data Identitas
  • File Data CV
  • File Proposal
  • Surat Perjanjian
Nama Berkas Ukuran Berkas
Berkas SOP/Formulir/Ajuan Layanan 0.13 MB
Template Surat Pengantar 0 MB
Template File Data Transkrip 0 MB
Template File Data Foto 0 MB
Template File Data Identitas 0 MB
Template File Data CV 0 MB
Template File Proposal 0 MB
Template Surat Perjanjian 0.03 MB

Layanan Terkait