Bimbingan Teknis dan Pembuatan Akun Single Particle Reconstruction
Bimbingan Teknis dan Pembuatan Akun Single Particle Reconstruction
Layanan Kontraktual


DESKRIPSI LAYANAN | Layanan Bimbingan Teknis dan Pembuatan Akun Single Particle Reconstruction (CryoSPARC) – ELSA BRIN Layanan ini ditujukan untuk pengguna yang akan melakukan analisis Single Particle Reconstruction (SPR) menggunakan platform CryoSPARC pada fasilitas Electron…

  • Laboratorium Fisika dan Instrumen Pencitraan Maju - Cryo-EM Resolusi Menengah
  • Direktorat Pengelolaan Laboratorium, Fasilitas Riset, dan Kawasan Sains dan Teknologi
  • KST Cibinong (Soekarno)
    Gedung Genomik Lantai 1 Jl Raya Bogor Km 46 Cibinong - Bogor Jawa Barat
  • 08119811578
  • cryo-em@brin.go.id
  • Satuan Layanan: Per Kontrak
  • Waktu Pengerjaan Layanan: 1 Hari Kerja
  • Kuota Pelayanan Per Hari: 1
  • Kapasitas Layanan: 1 Per Kontrak
  • Jumlah Minimal Pengajuan: 1
Marketing Office
Deputi Bidang Infrastruktur Riset dan Inovasi BRIN
layanan_sains@brin.go.id
Ajukan Layanan

Layanan Bimbingan Teknis dan Pembuatan Akun Single Particle Reconstruction (CryoSPARC) – ELSA BRIN
Layanan ini ditujukan untuk pengguna yang akan melakukan analisis Single Particle Reconstruction (SPR) menggunakan platform CryoSPARC pada fasilitas Electron Microscopy BRIN (KRIOS dan TUNDRA).

Persyaratan Peserta
1. Dianjurkan pengguna telah memiliki data hasil akuisisi Cryo-EM dari Laboratorium CryoEM BRIN (baik dari mikroskop KRIOS atau TUNDRA).
2. Pengguna telah memiliki atau mendaftar lisensi CryoSPARC yang dapat diperoleh secara resmi melalui situs: https://cryosparc.com/download

Bimbingan teknis ini mencakup:
1. Pembuatan akun pengguna CryoSPARC di server ELSA BRIN.
2. Instalasi dan konfigurasi CryoSPARC, termasuk koneksi dengan GPU dan penyimpanan data pengguna.
3. Pengenalan antarmuka CryoSPARC dan pengaturan proyek (project directory, workspace, dan data import).
4. Tahapan dasar analisis Single Particle Analysis (SPA), meliputi:
    - Import dan pre-processing data (motion correction dan CTF estimation)
    - Particle picking dan extraction
    - 2D classification
    - Initial model generation
    - 3D refinement

Tujuan:
Memberikan pemahaman teknis dan pendampingan bagi peneliti untuk:
Mengelola akun dan data CryoSPARC secara mandiri.
Melakukan pemrosesan dasar Single Particle Analysis dari data CryoEM dengan baik dan efisien.

Output Layanan:
Akun pengguna CryoSPARC aktif dan siap digunakan.
Pengguna memahami alur kerja dasar pengolahan data Single Particle Reconstruction di platform CryoSPARC.



Syarat Pengajuan:
  • File Data Foto
  • File Dukung Lainnya
Nama Berkas Ukuran Berkas
Berkas SOP/Formulir/Ajuan Layanan 0.02 MB
Template File Data Foto 0 MB
Template File Dukung Lainnya 0 MB

Layanan Terkait